Своей миссией после распада СССР Джеймстаунский фонд называет «информирование разработчиков политики и более широкое политическое сообщество о событиях и тенденциях в тех обществах, которые стратегически или тактически важны для США и которые зачастую ограничивают доступ к такой информации». В руководящий совет фонда вошли бывший советник президента США по национальной безопасности Збигнев Бжезинский и бывший директор ЦРУ Джеймс Вулси. Главой организации стал Глен Ховард, он же глава Американского комитета за мир на Кавказе.
Фонд выпускает бюллетень Американского комитета за мир на Кавказе Chechnya Weekly.
В 2006 году в Вашингтоне фонд провёл семинар «Кавказский фронт Садуллаева: перспективы нового Нальчика». Спустя 4 дня американскому послу в России Уильяму Бёрнсу в МИД России была вручена нота протеста.
Под видом «благотворительной» деятельности Джеймстануский фонд проводит всевозможные семинары, подкармливает отдельных представителей народов Кавказа, ведущих подрывную деятельность. Эти люди ловко манипулируют проблемами региона, пытаются раздуть межэтническую напряженность.
28 ноября 2007 года фонд провёл семинар под названием «Будущее Ингушетии», в котором принимали участие бывшие боевики Аслана Масхадова, один из них выступил с сообщением «Ингушский джамаат — новое лицо сопротивления на Северном Кавказе». На семинаре звучали рассуждения о том, что в Ингушетии якобы сложилась «революционная ситуация» и единственный, кто может «исправить ситуацию» — отряды боевиков во главе с известным своими злодеяниями полевым командиром Ахмедом Евлоевым (он же «Магас»).